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火影忍者世界中能量体系大致可以分为两大体系：
一、从自身开发的查克拉——是精神能量和身体能量完美融合所产生的一种能量。
简单来说，就是使用忍术时必需的能量。而这种能量大致来说是由：1.从人体130兆个细胞里，一个一个细胞摄取的身体能量。2.经历许多修炼、积累经验而锻炼的精神能量。是施展忍术，幻术和体术的能量来源。也可以制成线状捆绑对手或切断同为查克拉所构成的物质。也就是说所谓“忍术”是从体内摄取这两种能量，经过提炼（这称为提取查克拉）的意志，经由“结印”这种步骤后才会发动。查克拉分为七个属性：火、水、风、雷、土、阴、阳。前五个属性两两相克：火克风、风克雷、雷克土、土克水、水克火。阴的性质变化比如奈良一族的影子束缚术、山中一族的心灵忍术等，而阳的性质变化比如秋道一族的倍化术、医疗忍术等。
另外，尾兽的查克拉与忍者的查克拉有所不同。表现在更强的威力与更难控制方面。但在“质”和“量”上均要强于一般忍者的查克拉。分别由这五种查克拉可以组成火遁、风遁、雷遁、土遁、水遁。有两种查克拉同时发动可以组成新的遁，如：炎遁+风遁=灼遁；水遁+土遁=木遁（大和）；水遁+风遁=冰遁（白）；火遁+土遁=熔遁（四尾人柱力）等。另外还有晶遁（红莲）、火遁+水遁=沸遁（五代水影）等。
已知的属性有：火遁、水遁、风遁、雷遁、土遁、炎遁、冰遁、熔遁、岚遁、晶遁、木遁、冥遁、迅遁、钢遁、灼遁、沸遁、磁遁、爆遁、尘遁、溶遁。
二、仙人模式
是一种可使用仙术查克拉的状态，威力是普通状态下的数倍甚至数十倍，而且可以使自己具备超强的感知能力。进入仙人模式后，身体会仙人化，而根据所吸收自然能量性质的不同会产生不同变化。根据仙人脸谱可以判定使用者仙人模式的完美程度，即对自然能量的控制程度。
人本身发动忍术是依靠发动体内的查克拉发动，普通的查克拉是通过自己的身体能量和精神能量混合所得到的，而仙术查克拉就是在此基础上吸收自然能量（循环于世界的能量）并完美融合后形成的。
但是，要维持三种查克拉平衡，就各是三分之一才能发动。如果超过三分之一，就会被自然之力吞噬，如果不到三分之一，就不能发动仙人模式。
当然还能划分的更细，这里就不多说了。
